This tool comes in handy は、「この道具が必要な場面で役に立つ」という表現です。
単に性能がよいと言うより、ある目的や状況で実際に助かったことへ焦点があります。
This phrase comes in handy when you need a moment to think. では、考える時間が必要な場面で表現が役立ちます。
まだ使っていない物については、will / might / can come in handy のように言えます。
実際に助かった結果を振り返るときは、came in handy と過去形にします。
主語はtoolだけでなく、money、map、phrase、skill、adviceなど、役立つ物・情報・能力へ替えられます。
役立つ場面はwhen節、if節、for + 名詞 / -ingで続けられます。
会話でよく使うややinformalな表現ですが、日常的な説明文でも自然です。
一般的な有用性を中立に述べるならbe useful、時間や手間の省きやすさならbe convenientが分かりやすい選択です。
come in usefulは主にイギリス英語で使われる近い表現です。